El proceso de integración iniciado desde mediados del año 2003, con la nueva Sede Pedro J. Gómez, implicó una serie de transformaciones desde nuestro quehacer institucional, acordes con la filosofía y principios institucionales, en virtud de la construcción de identidad, por lo que se inició la recepción y el estudio de propuestas de modificación del himno institucional para su musicalización, desde septiembre de 2003.
En el año 2004, por Acuerdo del Consejo Directivo N° 022, se adoptó el nuevo Himno con arreglos de la autoría del profesor JOHN JAIRO YEPES BETANCUR y la musicalización de ANDRÉS YEPES LÓPEZ, padre e hijo, como Himno Oficial de la Nueva Institución Educativa Eduardo Santos y continúa siendo un canto desde los valores y principios santistas, al hombre que pretendemos formar en nuestra Institución Educativa Eduardo Santos.
CORO:
Entonemos Santistas el himno,
que en tu entorno refleje el amor,
en tus aulas se forja el destino
aquí nace la noble laborIVivirás siempre en nuestra memoria,
se acrecienta la paz y el saber.
Hombres nuevos haciendo la historia,
el presente , el futuro , el ayer.
En tu espacio estudiamos con gozo,
anhelando el saber alcanzar.
Se ilumina un sendero glorioso,
con tu lema sagrado: ¡Triunfar!IICuando al fin nuestra meta alcancemos,
la alegría y el aplauso vendrán.
Con la ayuda de Dios hallaremos,
la justicia, la paz, la verdad.
La bandera que ondea en tu cielo,
en mi inspira respeto y fervor.
Como aves que marchan al vuelo,
seguiremos un Norte de honor.